传说因为石南寺位于迦智山(或称石眼山)的南边，而被称做为石南寺。自今1200多年以前，道义国师于新罗宪德王16年(824年)创建此寺，期间历经多次重建整修。壬辰倭乱时烧毁，后于1674年朝鲜宪宗15年，由卓灵、善哲禪师等人重建；1803年纯组3年，由枕虚、守一等人整修；1912年，在友云师父主持下，再度重新整修。1957年比丘尼仁弘禪师受任住持之后，寺庙的各个建筑焕然一新直到现在。石南寺建筑共有30餘栋，与闻庆凤巖寺并列为韩国佛教曹溪宗所属80多间禪院下的宗立特别禪院，因而声名远播。
韩国的南宗禪始祖道义禪师曾在中国修行37年，锦衣还乡后因当时国家还无法接受他的核心理念，而独自到雪岳山陈田寺内教导弟子并等待时机，之后转移至迦智山创建石南寺。石南寺属于比丘尼的修道处，有许多比丘尼在此专注修行。这里的三层石塔是824年道义禪师在护国愿望下建造了下面2层基坛、上头3层的石塔，原本的位置在大雄殿前面，1973年时移至现在的位置。寺内保存有蔚州石南寺僧塔(宝物第369号)、3层释迦舍利塔、3层石塔(地方有形文化财第5号)、石南寺水槽(文化财资料第4号)等文物。
* 蔚州石南寺僧塔 (宝物第369号 / 1963.01.21)
建造时代 : 统一新罗
增塔是为了供奉著名高僧遗骨而建造的石塔，此僧塔高3.53m，为八角圆堂形，传说为道义国师的舍利塔。完整保存了统一新罗末期的僧塔样式，是非常卓越的作品。
