天然纪念物中心旨在通过对自然遗产天然纪念物和名胜进行系统地调查、研究、展示、教育，向国民强调自然遗产的价值和重要性，是一处国家研究机关。这里主要展示了对自然一处的研究成果，其中有恐龙蛋、恐龙脚印及化石、亚洲黑熊、水獭、老鹰的动物标本及存道里松树等植物标本，针对专业的研究学者和青少年的学习有很大帮助。此外，体验空间、影像室等地还为游客提供了只有在天然纪念物中心才可参与的创意性体验学习机会。另外， 通过与联合国教科文组织、世界各国自然遗产专业机构、自然史博物馆的学术交流，使其本身更加壮大。在天然纪念物中心的户外学习场内，恐龙痕迹的化石、生态莲池、自生植物学习场等设施齐全，俗离山的正二品松、六道木居等天然纪念物亦在这里被加以保护和培育。